对每个基因设计并检测两到四个siRNA序列 为了找到潜在靶位点,扫描靶基因中的AA序列。记录每个AA 3’端19个核苷酸作为潜在siRNA靶位点。潜在靶位点需通过GENBANK数据库的BLAST分析,去除那些与其它基因明显同源的靶位点。如果可能,siRNA应根据mRNA低二级结构的区域设计。 选择低GC含量的siRNA 纯化体外转录siRNA 在转染前要确认 …
阅读更多 »请问siRNA转染后48h PCR已经敲低到30%以下,但是60h收蛋白,蛋白显著上调。是什么原因,如何在蛋白水平敲低呢?
对于您的问题,siRNA转染后48小时PCR显示基因表达水平已经显著降低到30%以下,但在60小时检测蛋白时,蛋白水平却出现显著上调,这种情况可能有以下原因和应对方法: 可能的原因: 蛋白降解滞后性:即使mRNA水平在48小时时已经显著下降,但蛋白的降解可能需要更长的时间。蛋白具有相对较长的半衰期,因此在mRNA水平下降之后,蛋白水平的下降会有一定的延迟。 …
阅读更多 »如何通过电穿孔转染DNA?
试剂 运载 DNA l0mg/mL 细胞生长培养基 电穿孔缓冲液 指数生长的培养细胞 线性化或环状质粒DNA ( 1 ~ 5μg/μL , 溶于无菌去离子水) 磷酸盐缓冲液( PBS ) 胰岛素 设备 电穿孔杯 电穿孔仪器 血细胞计数器 组织培养皿或多孔培养板 组织培养瓶(75cm2) 方法 准备电穿孔用细胞。 对于贴壁细胞 电穿孔前一天,通过胰酶消化释放贴 …
阅读更多 »细胞转染实验中易出现的问题
细胞转染是细胞生物学和分子生物学的一种常用的技术手段。而转染效率低下却是实验人员经常遇到的问题,尤其是原代细胞转染,转染难度更大。现分享几个细胞转染实验中易出现的问题,望实验人员能够注意。 1.准备不足 做细胞转染的时候,在开展正式实验前要多做预试验,优化转染条件。优化转染条件包括:转染试剂的用量、DNA密度、细胞密度、试剂和DNA混合孵育时间等等。 2.细 …
阅读更多 »如何选择哺乳动物高效表达载体
选择适合哺乳动物细胞的高效表达载体时,通常需要考虑以下几个关键因素: 1. 目标蛋白的特性 蛋白大小和复杂性:如果你的目标蛋白比较大或具有复杂的后期修饰(如糖基化、磷酸化等),你需要确保载体能支持这些修饰。哺乳动物细胞通常用于表达这种需要后修饰的蛋白。 表达水平:有些载体可以提高蛋白表达的水平。你可以根据实验需要选择一个具有高表达效率的载体。 2. 选择合适 …
阅读更多 »如果细胞密度低,铺板48h可以转染吗?
如果细胞密度较低,一般来说,细胞在转染前的培养时间是很关键的。48小时的培养时间通常是足够的,但是否适合转染还要考虑几个因素: 1. 细胞的生长状态 细胞在转染时最好处于对数生长期,也就是细胞在活跃分裂和增殖中。若细胞密度过低,可能会处于生长迟缓或衰退状态,这会影响转染效率。 细胞密度太低(<30%):如果细胞太少,可能会影响转染试剂的吸附和细胞的转染 …
阅读更多 »细胞转染实验的关键点
1.细胞密度 一般来说,当细胞密度达到60%~80%时进行转染可以取得较高的转染效率,过低或过高都会影响转染效果。 2.细胞状态 这点非常关键,很多时候传代次数太少或者太多都将导致细胞对转染试剂敏感度的改变。因此,为了提高转染效率以及转染稳定性、降低细胞毒性,应尽量使用适度传代的细胞系,并在不同次实验时保持细胞传代次数的一致性。 还有,尽量选择无 …
阅读更多 »RNA转染过程中细胞毒性大怎么办?
RNA转染时细胞毒性大可能的原因有: 1.RNA与转染试剂比例不佳。建议进行预实验优化。 2.细胞密度不佳。调整细胞密度。 3.细胞污染。建议彻底清洁所有细胞培养相关用品。 4.转染试剂毒性较大。建议选择毒性较小的非脂质体转染试剂,如纳米材料的Entranster试剂等。
阅读更多 »悬浮细胞难转染怎么办?
悬浮细胞是指细胞生长不依赖支持物表面,在培养液中呈悬浮状态生长,如淋巴细胞。在实验室经常会遇到悬浮细胞的转染,其和贴壁细胞转染还是有很大不同的。 目前大多数实验室用的是脂质体类的转染试剂,脂质体转染是基于电荷吸引原理,先形成脂质体-DNA复合物,散布在细胞周围,然后通过细胞的内吞作用,将目的基因导入细胞内,而脂质体复合物与贴壁细胞的接触机会 …
阅读更多 »为什么我的细胞转染效率低?
1)优化条件:质粒不同,所转染的细胞不同及定量的准确性等因素会导致在一些情况下所做的转染不在该优化条件内。这种情况下需要对质粒转染试剂的配比进行优化。另外,可选用更合适的转染试剂,如Entranster试剂。 2)抑制剂:不要在用于制备DNA-转染试剂复合物的培养基中使用抗生素,EDTA,柠檬酸盐,磷酸盐,RPMI,硫酸软骨素,透明质酸,硫酸葡聚糖或其他硫酸 …
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