双脱氧测序法速度快。引物的复性和测序可以在60~90 min 内完成。可以同时制备大量的单链或双链测序样品。如果用35 S标记的dNTP 测序,这种方法可以提供极好的(电泳)条带的分辨率。其主要缺点是模板的组成或二级结构有时会导致测序过早地终止。虽然和Klenow 片段相比,有其他的聚合酶可以减轻这个问题,但有些DNA 序列还是无法用双脱氧法精确地测出来。 …
阅读更多 »新型核酸分子荧光探针——分子信标的原理及应用
分子信标(molecular beacon)是一种具有发夹结构的新型荧光标记核酸探针,具有高灵敏度、高特异型,其在聚合酶链反应(PCR)、核酸序列的分析、活细胞内核酸的动态检测、蛋白质(酶)与核酸的相互作用等方面具有广泛的应用。 分子信标的结构 分子信标的结构一般包括三个部分:环状区、信标茎干区、荧光基团和猝灭基团。荧光基团一般联接在信标分子的5 端;猝灭基 …
阅读更多 »无菌操作的注意事项及常见问题
做不同的实验,操作上会有小小的不同,而且不可能每个动作都被描述,所以实验时必须注意自己的动作。通常要注意的就是每项操作时都要尽可能减少污染的可能性,所以动作要尽量减少。 距离,尽量将所需要的物品放在离手最近的地方。距离越近,移动就越少。 暴露,在空气中移动物品的时间越长,接触空气中微粒的概率则越大。试剂瓶敞口在空气中的时间越长,掉落进去的空气中的微粒越多。灼 …
阅读更多 »哪些因素会造成western-blot发光时发生荧光“淬灭”?
荧光淬灭是Western Blot发光时常见的现象,即加ECL发光液后立刻可以看到很明显的亮光,但亮光很快就消逝了,压完片后条带却很弱,甚至没有条带,发生这种情况的原因可能有以下几个方面: 1. 抗体浓度太高,局部过多的HRP会快速消耗底物,导致荧光信号过强,条带呈灼烧样。可降低抗体上样量。 2. 抗体浓 …
阅读更多 »应用siRNA 抑制特定基因的活性
长链dsRNA 的导入能够在小鼠卵母细胞、早期胚胎、胚胎干细胞和胚胎癌细胞( Svoboda et al. 2000; Wianny and Zemicka-Goetz 2000; Billy et al. 2001; Yang et al. 2001),以及植物、蠕虫、果蝇体内诱导特定和高效的RNA 干扰。但是,早期在哺乳动物体细胞中用长链dsRNA 诱导 …
阅读更多 »抗体标记的步骤
下列步骤描述了使用Cy3作为代表性标记试剂, 用荧光succinimidy l 活性酶标记羊抗体。其他水溶性荧光标记物的使用与此类似(Mujumdar et al. 1993) 抗体分离与纯化 来源于血清,腹水或培养基的抗体,在标记反应开始以前,需纯化以除去蛋白质和其他含有氨基团的分子。在与标记反应混合以前,抗体不应进行强缓冲处理,不然标记混合物会降低,所有 …
阅读更多 »采用dsRNA 浸泡果蝇S2 细胞进行RNA 干扰
该方案是一种通过用含有dsRNA 的培养液浸泡果蝇S2 细胞来诱导RNA 干扰的简便方法。与转染方法相比,浸泡操作需要的步骤更少,因此可用于高通量的RNA 干扰筛选。而且, 浸泡避免了转染试剂可能带来的毒性,但是,通过浸泡向果蝇S2 细胞转运dsRNA 的效率与转染方法相比较低。对于通过浸泡dsRNA 难以抑制其表达的基因,可以通过多次转染dsRNA 获得抑 …
阅读更多 »去除去污剂的可行性
去除去污剂的可行性(根据Harlow 和Lane 1988) 离子型去污剂 用分子筛G25 柱子进行凝胶过滤,对于一些蛋白质来说,用低于临界微团浓度的另一种去污剂来平衡柱子。 加入8 mol/L 的尿素, 然后把去污剂加到离子交换柱上,让蛋白质在8 mol/L 的尿素中流动,再透析去除尿素。 对于离子型的去污剂,有一个相对较低的微粒大小和较高的临界微团浓度, …
阅读更多 »建立透析的方法步骤
1. 剪下一段足够装得下要透析物质的透析袋,在每个末端留下大概2 英寸(总共留下4英寸)来捆绑透析袋。(可以买到特殊的管子来进行微量的透析。)2. 透析袋的两端都要打结,或者用透析夹封住末端。3. 用戴手套的手打开透析袋的一个末端,另一个手拿住透析袋,把样品认真地装入透析袋中。4. 扎住或者夹住透析袋的末端,夹住之前先挤压赶走气泡,检查渗漏,尤其注意末端。5 …
阅读更多 »cDNA文库构建分为哪些阶段?
cDNA文库不同于基因组文库,被克隆DNA是从mRNA反转录来源的DNA。cDNA组成特点是其中不含有内含子和其他调控序列。从而做cDNA克隆时应是先从获得mRNA开始,在此基础上,通过反转录酶作用产生一条与mRNA相互补的DNA链,然后除掉mRNA,以第一条DNA链为模板复制出第二条DNA链(双链);再进一步把此双链插入原核或真核载体。 cDNA文库的构建 …
阅读更多 »