1.纯化siRNA siRNA的浓度和纯度对转染实验非常重要。为得到高纯度的siRNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致siRNA转染实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如皮 …
阅读更多 »小鼠大脑皮层神经元原代细胞培养步骤
小鼠大脑皮层神经元原代细胞培养步骤: 1、 于无菌条件下切取鼠头并以75%酒精浸泡1min,解剖出完整鼠脑; 2、 预冷解剖液中分离去除软膜、血管、取大脑皮质漂洗,用眼科剪将皮质反复剪切成碎块; 3、 移入培养皿中,吸除解剖液加入0.25%胰蛋白酶2m1,37℃培养箱中消化30min; 4、 将皮层组织碎块移入离心管,弃去剩余消化液,用接种液洗3次,每次洗涤 …
阅读更多 »如何做好细胞转染实验?
1.选择合适的转染试剂 不同细胞系转染效率通常不同,但细胞系的选择通常是根据实验的需要,因此在转染实验前应根据实验要求和细胞特性选择适合的转染试剂。每种转染试剂都会提供一些已经成功转染的细胞株列表和文献,通过这些资料可选择最适合实验设计的转染试剂。当然,最适合的是高效、低毒、方便、廉价的转染试剂。如Entranster试剂。 2.保持最佳的细胞状态 一般低的 …
阅读更多 »siRNA转染效率不理想的原因有哪些?
siRNA转染效率不理想,常见的原因有: 1. RNA与转染试剂比例不佳 由于RNA序列差异、合成条件不同以及是否带有荧光等标记,决定了RNA和转染试剂在不同情况下会有不同的最佳条件,建议先进行预实验优化。 2. 细胞密度不佳 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。成功转染siRNA的细胞会产生目标基因表达下调,但未成功转染的细胞却不受影响,这时转染效率 …
阅读更多 »如何提高qPCR反应的灵敏度与特异性?
首先确定模板RNA完整性好,无DNA污染。 RNA模板中不应含有扩增反应抑制剂。 为了防止模板降解,在反应体系中加入RNase抑制剂RNasin。 使用适量的模板RNA,模板量太多会降低特异性,太少会导致扩增不出条带或条带太弱。 若模板中有二级结构,可通过提高逆转录反应温度来提高扩增效果。 设计引物时,避免在引物3’端含有互补序列,避免形成内部发卡结构。 可 …
阅读更多 »世界上最遥远的距离之荧光定量PCR
世界上最遥远的距离不是天涯海角,而是我天天和你在一起,你却不了解我。 荧光定量PCR常做,相关概念常说,可它们到底啥意思? 荧光定量PCR中基线、阈值、Ct值、扩增曲线、熔解曲线等基本概念 基线(Baseline):是指在PCR扩增反应的最初数个循环里,荧光信号变化不大。接近一条直线,这样的直线即是基线。 荧光域值(threshold)的设定:一般将 PCR …
阅读更多 »浅析细胞转染效率低下的原因
影响细胞转染效率低下的原因主要有: 1、细胞太少或细胞密度太大 细胞密度对转染效率有一定的影响。不同的转染试剂,要求转染时的最适细胞密度各不相同,即使同一种试剂,也会因不同的细胞类型或应用而异。转染时过高或者过低的细胞密度会导致转染效率降低,乃至表达水平偏低。因此如果选用新的细胞系或者新的转染试剂,最好能够进行优化实验并为以后的实验建立一个稳定方法,包括适当 …
阅读更多 »siRNA转染后出现细胞死亡是什么原因?如何优化转染条件?
siRNA转染后细胞死亡,原因也是多样的,如脂质体毒性,转染浓度过高,转染前的细胞状态不佳等都可能导致转染后细胞死亡的情况发生,这种情况下就需要适当优化转染条件;可以选择细胞毒性小的非脂质体类的转染试剂,如Entranster试剂,另外,如果siRNA所靶向的基因对于维持细胞生长是非常 …
阅读更多 »提高PCR特异性的策略有哪些?
1、巣式pcr(Nest-PCR)可增加稀有靶序列的灵敏度;降低了扩增多个靶位点的可能性;提高PCR特异性 2、递减PCR(Touch Down PCR):前几个循环使用严谨的退火条件提高特异性;循环设在比估算的Tm高大约5℃的退火温度下开始,然后每个循环降低1-2℃,直到退火温度低于Tm 5℃ 。适合用于AFLP、DNA指纹分析等。 3、热启动PCR:抑制 …
阅读更多 »Hela细胞转染后几小时死亡是什么原因?
可能有多种原因:目标蛋白对细胞有毒性,导致细胞死亡;转染试剂以及DNA用量信息需要优化,否则对细胞具有伤害;细胞贴壁转染之后没有正常换液。 建议:考虑对目标蛋白进行截短构建、尝试其他细胞系统;摸索转染试剂以及DNA用量信息,如果转染试剂毒性太大,可以考虑尝试Entranster转染试剂。对转染后的细胞进行换液处理,如果细胞状态感觉不够理想,可以考虑添加一些血 …
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