【试剂与器材】 (一)试剂 1. 0.1mol/L NaOH ,每组200mL 2. 寡聚Oligo(dT)-纤维素 3. 加样/洗涤缓冲液1:0.5 mol/L NaCl, 20 m mol/L Tris-HCl(pH 7.6),每组250mL 或0.5mol/L NaCl, 20mmol/L Tris-HCl(pH7.6), 1mmol/L EDTA(p …
阅读更多 »DNA 样品的酚抽提
酚抽提通常用来对DNA 或RNA 样品进行蛋白质的去除。酚与水不互溶,当它们混合时会形成两相,水相和酚相。当含有DNA 的水溶液与酚混合时,蛋白质会进入酚相,再将含DNA 的水相取出进行再抽提和乙醇沉淀浓缩。 一、材料 抗有机溶剂的塑料管,尝试尽可能小的体积,大多数的抽提可以在微量离心管中进行。 TE 饱和的酚:氯仿:异戊醇(25 : 24:1) 氯仿:异戊 …
阅读更多 »SDS 碱裂解法制备质粒DNA: 大量制备
近些年来,随着PCR 技术的出现,以及DNA 克隆和测序方法的发展,对大量质粒载体和重组子的需求也大大减少。因此,本方案曾一度广泛应用,但已经被更为快速和简便的柱纯化方法代替。在本方案中,通过碱裂解法的放大( Bimboim and Doly 1979 ) ,质粒DNA 可从清亮的细菌裂解物中通过含有溴化乙锭的CsCl 梯度离心来进行纯化。 无论是高拷贝数的 …
阅读更多 »降落PCR实验原理及步骤
降落PCR(touchdown PCR),一种PCR技术,主要用于PCR的条件的优化。在许多情况下引物的设计使得PCR难以进行,例如特异性不够易错配等。退火温度过高会使PCR效率过低,但退火温度过低则会使非特异扩增过多。 实验材料: 基因样品 仪器、耗材: PCR仪 实验步骤: 1、反应体积为50 μl。 2、人CD137胞膜外区基因的PCR扩增体系:CD1 …
阅读更多 »新型核酸分子荧光探针——分子信标的原理及应用
分子信标(molecular beacon)是一种具有发夹结构的新型荧光标记核酸探针,具有高灵敏度、高特异型,其在聚合酶链反应(PCR)、核酸序列的分析、活细胞内核酸的动态检测、蛋白质(酶)与核酸的相互作用等方面具有广泛的应用。 分子信标的结构 分子信标的结构一般包括三个部分:环状区、信标茎干区、荧光基团和猝灭基团。荧光基团一般联接在信标分子的5 端;猝灭基 …
阅读更多 »慢病毒感染后,未能实现相关敲降的原因是什么?
慢病毒感染后未能实现敲降的原因可能有多种。以下是一些可能的原因及其解释: 慢病毒包装质量问题: 病毒滴度较低,导致感染效率不高,可能无法有效转导目标细胞。 病毒颗粒中没有足够的有效载体,影响敲降效果。 靶向序列设计问题: shRNA或sgRNA设计不合理,没有有效靶向目标基因的序列。 目标序列与基因组其他部位的相似性导致脱靶效应,影响敲降效果。 感染条件不佳 …
阅读更多 »常用抗生素溶液有哪些?
贮存液a 工作浓度 抗生素 浓度 保存条件 严紧型质粒 松弛型质粒 氨苄青霉素 50mg/ml(溶于水) -20℃ 20μg/ml 60μg/ml 羧苄青霉素 50mg/ml(溶于水) -20℃ 20μg/ml 60μg/ml 氯霉素 34mg/ml(溶于乙醇) -20℃ 25μg/ml 170μg/ml 卡那霉素 10mg/ml(溶于水) -20℃ 10μ …
阅读更多 »ChIP超详细实验步骤
ChIP的一般流程: 甲醛处理细胞—收集细胞,超声破碎—加入目的蛋白的抗体,与靶蛋白-DNA复合物相互结合—加入ProteinA,结合抗体-靶蛋白-DNA复合物,并沉淀—对沉淀下来的复合物进行清洗,除去一些非特异性结合—洗脱,得到富集的靶蛋白-DNA复合物—解交联,纯化富集的DNA-片断 …
阅读更多 »Western-Blot中BSA,脱脂蛋白的作用是什么?
经常有人做Western-Blot会疑惑:为什么做蛋白实验,应该把杂蛋白去除才对,会担心其他蛋白的加入会影响实验结果,增加背景。但为什么偏偏会用加入BSA,脱脂蛋白的方法减少背景呢? 这需要从Western-Blot的原理说起,Western-Blot中电泳转膜后让蛋白分布NC膜或PVDF膜上,但膜上还有很多地方是空白的,这些空白的地方如果不被封闭,很可能就 …
阅读更多 »色谱法分离蛋白质
色谱 与DNA 和RNA 一样,蛋白质可以进行常规的分离,或者用色谱法来分离。主要用的色谱法是凝胶过滤、 离子交换层析和亲和层析。 1. 凝胶过滤,基于分子的大小对物质进行分离。 工作原理:固定相中包含有很多的孔,只有较小的分子才可以进入。 填料:葡聚糖(交联右旋糖苷)、Sephacryl (烯丙基葡聚糖和N, N-亚甲双丙烯酰胺 …
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