一、探针的标记 如下设置探针标记的反应体系: (1)待标记探针 (1.75 pmol/μl) :2μl (2)T4 Polynucleotide Kinase Buffer (10X) :1μl (3)Nuclease-Free Water :5μl (4)[γ-32P]ATP(3 000 Ci/mmol at 10 mCi/ml) :1μl (5)T4 P …
阅读更多 »RNA 定量-紫外(UV) 分光光度法
在进行大多数RNA 分析之前, RNA 定量是一种重要和必需的步骤。RNA 定量方法可以分为两类:紫外(UV) 分光光度法,此方法基于嘌呤和嘧啶碱基的吸收光谱; 基于荧光染料的方法,结合到核酸时选择性发荧光,测定荧光染料的强度。如果RNA 样品是纯的( 如没有诸如蛋白质、酚、琼脂糖或其他核酸的污染),用UV 分光光度法测量被碱基吸收的UV 射线简单而且精确。 …
阅读更多 »蛋白质实验的注意事项
降解是蛋白质纯化过程中最害怕发生的事情。 基本规则: 划重点:做关于蛋白质的实验时,手边一定要备一个冰桶,管子从冰箱或者冷冻的状况下取出时马上放到冰上。 1. 必须冷冻离心,因为离心会产热。 2. 了解蛋白质的特性。每一个蛋白质性质差异很大,热会使你的蛋白质变性吗?有二硫键吗?能反复冻融吗?如果你不知道,那假定它不能被冷冻和再解冻是热变性的。 3. 在细胞裂 …
阅读更多 »利用有机溶剂分离纯化高分子质量DNA
分子克隆最基础的操作可能就是核酸纯化了。去除蛋白质的关键步骤经常是简单地利用酚:氯仿和氯仿把DNA 从水相中萃取出来。这种萃取可在进行一步法克隆操作前有效灭活和去除蛋白酶。然而,如果是从复杂分子混合物如细胞裂解液中纯化DNA 时,则需要更多的检测。在这些情况下, 一般是在用有机溶剂萃取前,利用蛋白质水解酶如链霉菌蛋白酶或蛋白酶K (表1 ) 去除大部分蛋白质 …
阅读更多 »RNA提取的注意事项
RNA 降解是非常严重的问题,在RNA提取过程中,为防止降解我们需要遵守以下4点基本规则:基本规则1. 把所有接触RNA 的塑料制品以及玻璃制品都高压灭菌。 2. 用于RNA 缓冲液的所有水都要经DEPC 处理。加DEPC 到终浓度0.1% ,再室温放放置过夜,或者灭菌15 min 。DEPC 不能用于Tris 缓冲液,因为DEPC 将会降解成乙醇和二氧化碳 …
阅读更多 »分子克隆中常用的其他酶
一、DNA 聚合酶 分子克隆中的许多步骤都涉及在DNA 聚合酶催化下的DNA 体外合成反应。这些酶作用时大多需要模板,合成产物的序列则与模板互补。大多数聚合酶优先作用于DNA 模板,但也可拷贝RNA ,尽管这时效率较低。最常用的依赖于DNA 的DNA 聚合酶是大肠杆菌DNA 聚合酶 I (全酶)、大肠杆菌DNA 聚合酶I 大片段(Klenow 片段)、T4 …
阅读更多 »离心的种类和原理
离心方法主要有两种:制备型(用来分离某些颗粒)和分析型(用来了解分离颗粒的物理性质)。 分子或细胞生物学实验室中所作的决大多数离心机属于制备型离心机,而多数常规制备型离心是差速离心。 g 力和每分钟旋转次数(rpm) 是大略的值:取决于所用的离心机型号和转子。 差速离心(沉淀) 原理:样品在一定速度下离心,分成上清部分与沉淀部分。样品根据沉降速度不同得到分离 …
阅读更多 »PCR 标记DNA
PCR 是通过热稳定酶,在模板、dNTPs 和一组与片段3′ 序列互补的引物存在下,对插入物进行次序扩增(Saiki et al. 1988) 。PCR 技术提供的另一优势是在对插入片段的扩增中掺入修正的核苷酸,因此可以生产出不含载体的标记的探针,这排除了在其他方法如缺口翻译所导致的对载体序列的非特异性标记。 目前已有掺入生物素化核苷酸的方法(L …
阅读更多 »一步法同时提取细胞或组织中的DNA 、RNA 和蛋白质
本方案(Chomczynski1993) 可以从部分组织或细胞中同时提取RNA 、DNA 和蛋白质。像它的前身(Chomczynski and Sacchi 1987) 一样,此方法涉及用异硫氰酸胍和苯酚的单相溶液裂解细胞。加入氯仿产生第二(有机)相,从而DNA 和蛋白质被抽提,而RNA留在水相上清中。有机相中DNA 和蛋白质的分离,通过按顺序用乙醇、异丙醇 …
阅读更多 »蛋白质的长期保存——以冻干固体的形式保存
一种按适当配方制造的冻干蛋白质制剂能够在几年内保持稳定,即使是在室温(Carpenter and Chang 1996) ;然而,冻干配方的最佳溶液组成和工艺条件的研制远远超出了典型学术实验室的能力范围。一个主要的困难是大多数实验室中所用的冻干机通常没有控制样品温度的能力,不能达到低水平的残留水(如低于质量的1%~2%),而低水平的残留水是冻干产品长期保存活 …
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