英格恩生物技术博客 生物实验干货分享
蛋白质结构预测（Protein Structure Prediction）是一项利用计算方法预测蛋白质分子的三维结构的技术。由于蛋白质的功能很大程度上依赖于其三维结构，预测其结构对理解生物过程、药物设计等领域具有重要意义。然而，实验确定蛋白质结构（如X射线晶体学、核磁共振等方法）耗时费力，因此计算预测成为重要替代方法。 蛋白质结构预测的主要方法 同源建模（H …
阅读更多 »Green先生的科研生活手记(4)
原创文章，转载请注明出处。 孩童的无知无畏 苏格拉底说，“孩子在成人眼里是幼稚的，而成人在上帝眼里也是幼稚的”。 我想说，对生命科学的了解越多，我越觉得自己的浅薄无知，对生命也越敬畏。这也是我对生命科学研究爱恨交织的原因。 对大自然，或者生命，我们必须有非常敬畏的态度，生命不是稍纵即逝的感受，而是永恒的，虽然我们每个个体只能经历其中一小段。我们必须非常小心谨 …
阅读更多 »2022的七大热点技术： 靶向基因治疗、空间多组学……
1.完全基因组 在去年5月发表的预印本中，人类共有基因组序列 GRCh38 添加了近 2 亿个新碱基对，并撰写了人类基因组的最后一章。 GRCh38 于 2013 年首次发布，一直是一个有价值的工具，但也存在漏洞。主要是因为测序技术产生的读数准确但较短。它们的长度不足以明确地绘制出高度重复的基因组序列，包括覆盖染色体末端的端粒和在细胞分裂过程中协调新复制的 …
阅读更多 »2024诺贝尔化学奖得主David Baker和他的Rosetta模型
Rosetta模型是一套用于蛋白质结构预测、分子对接和设计的计算工具集，由2024年诺贝尔化学奖得主，华盛顿大学David Baker教授的实验室开发。Rosetta最初被设计用于蛋白质结构预测，但如今已发展成一套多功能的平台，被广泛应用于蛋白质折叠、蛋白质-蛋白质和蛋白质-小分子相互作用、以及新蛋白质设计等领域。 Rosetta模型的核心功能 1.蛋白质 …
阅读更多 »差点失去的硕士学位，被女友拯救了（一）
原创文章，转载请注明出处。 生物硕士苦啊，2年多了。课题仍然停滞不前。 话说我是一枚研究大脑基因功能的小硕，具体研究的是大脑某神经相关基因的功能，这个基因的功能事关人的智力认知，研究好了，会造福人类，想想真是激动啊。 可想想我的研究，却一点也无法激动。实验卡住了，卡住了……，拯救愚蠢的人类不容易啊！我不想拯救了，我硕士快毕不了业了！ …
阅读更多 »粪便菌群移植出新药丸了？
反复感染引起腹泻的艰难梭菌，是一件非常痛苦的事，对于这部分人群，粪便微生物群移植是一个不错的选择方案。来自健康捐赠者的粪便，通过结肠镜检查并研究发现了可以帮助恢复平衡的肠道微生物群落，他们可以帮忙消除潜在的致命感染。一种含有从人类粪便中分离出的细菌孢子的药丸，现在已经成功进行了 3 期试验，为首次批准此类药物铺平了道路。 艰难梭菌感染在老年患者中很常见，并且 …
阅读更多 »拯救了全球猪产业的冠状病毒变种历史，是否可以重现？
早在1946年——普渡大学的兽医研究人员发现，一种可怕的病毒入侵幼猪内脏的东西会导致幼猪腹泻、呕吐和体重减轻，最终导致大多数猪死亡。当时科学家们并不知道这种疾病的原因，这种疾病摧毁了美国的养猪场，事实证明，这种养猪户的噩梦是一种冠状病毒，被命名为传染性胃肠炎病毒 (TGEV)。 1970 年代，TGEV在世界范围内传播，过程中发生了一个奇怪的转变：TGEV出 …
阅读更多 »偶听李斯特的《第三号爱之梦》（Liebesträume No. 3 in A-flat major, S. 541/3），试着解读一下
偶听李斯特的《第三号爱之梦》（Liebesträume No. 3 in A-flat major, S. 541/3），试着解读一下。 一、历史与文化背景 1.1 创作背景 李斯特于1845年左右创作了《爱之梦》三首，这组作品最初是为声乐和钢琴而写的艺术歌曲（Lied），歌词取材于德国诗人费迪南德·弗雷利格拉特（Ferdinand Freil …
阅读更多 »siRNA是从牵牛花过表达发现的吗
siRNA（small interfering RNA, 小干扰RNA）并不是从牵牛花的过表达现象中发现的，而是从研究植物基因沉默和RNA干扰现象中逐步发展起来的。siRNA的发现归功于对基因沉默和RNA干扰机制的研究，尤其是科学家在植物、真菌和线虫等生物中对这些现象的观察和研究。 siRNA发现的关键研究 植物基因沉默：在植物中，科学家观察到特定基因可以在 …
阅读更多 »甜味使我们获得能量，苦味提醒我们潜在的毒性，酸味其实是……
原来动物也能尝到酸味 咬一口柠檬，你可能会体验到一种强烈的感觉：直击大脑的刺激、令人垂涎的酸味和令人愉悦的气味。作为五种主要口味之一的酸味在生活中十分常见（酸味、甜味、咸味、咸味和苦味）——但科学家们对酸味是如何演变的知之甚少。最近发表在英国皇家学会学报的一篇论文，探讨了酸味的起源与作用。 很多物种在进化过程中失去了大多口味。比如海豚除了咸味之外，似乎没有任 …
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