1.纯化siRNA siRNA的浓度和纯度对转染实验非常重要。为得到高纯度的siRNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致siRNA转染实验失败。由于实验环境中RNA酶普遍存在,如皮 …
阅读更多 »RNA转染与表观遗传学分析和非洲绿猴抗艾滋病机制研究
非洲绿猴(African Green Monkeys, AGM)是猿免疫缺陷病毒(SIV)的天然宿主,虽然SIV复制水平较高,但不会发展为艾滋病。在健康成年AGM中观察到CD4(+)T细胞的降低和CD8(dim) T细胞升高,这可能部分解释了SIV诱导的疾病进展的缺失。阐明使这种天然宿主与SIV共存而无进展性疾病发生的机制可能有助于了解艾滋病的 …
阅读更多 »影响RNA转染实验的因素有哪些?
1. 转染试剂 转染中要额外注意的就是转染试剂应该是确认无RNase污染的,而且也尽量避免和质粒DNA转染混用——即使试剂本身兼容DNA和RNA转染,因RNA与DNA大小不同,转染条件不同,所需的试剂也应不同,所以RNA专用的转染试剂会更好一些。比如Entranster-R4000. 2. RNA转染时RNA的用量 RNA转染的用量必须参考RNA转染试 …
阅读更多 »RNA转染影响因素
1.转染试剂 转染中要额外注意的就是转染试剂应该是确认无RNase污染的,而且也尽量避免和质粒DNA转染混用—即使试剂本身兼容DNA和RNA转染,因RNA与DNA大小不同,转染条件不同,所需的试剂也应不同,所以RNA专用的转染试剂会更好一些。比如Entranster试剂. 2.RNA转染时RNA的用量 RNA转染的用量必须参考RNA转染试剂说明,因为RNA和 …
阅读更多 »shRNA转染实验步骤
下面以Entranster-R4000试剂为例,说一下shRNA转染步骤(24孔板) 1.提前1天细胞种植 贴壁细胞:提前一天将细胞种植在24孔板中,以转染时细胞汇合度(Confluence)在30%左右为宜,转染前全培养基总量为0.45ml。 悬浮细胞:采用对数生长期的细胞,数量为常规培养细胞数的1/3进行转染实验。如某细胞常规培养的细胞数是6×105,那 …
阅读更多 »siRNA转染(Entranster)与细胞骨架蛋白和肝肺综合征研究
肝肺综合征(HPS)是肝病,肺内血管扩张(IPVD)和低氧血症的三联征,动脉低氧血症可引起肺血管重构(PVR)。在最近的研究中,与HPS有关的PVR中肺动脉平滑肌细胞增殖中的作用已确定;细胞骨架蛋白的变化在细胞增殖中起着重要的作用。但与HPS有关的PVR中细胞骨架蛋白表达与分子机制相关性知之甚少。现分享一篇siRNA转染(Entranster- …
阅读更多 »揭秘RNAi,缔造实验神话
用siRNA进行transient transfection不稳定,几代细胞以后,症状就会消失,所以在转染几天(1-3)后要立刻抽提蛋白,进行分析。 用质粒中的shRNA进行转染,如果质粒含有抗生素位点,可以进行筛选,获得较稳定的细胞株系,但需要时间较长 用病毒中的shRNA进行感染(infection),抗生素筛选后,可以获得很稳定细胞株系。 瞬时RNAi …
阅读更多 »RNA转染(Entranster)与三氯乙烯和肝癌发生研究
三氯乙烯(TCE)是一种挥发性有机化学试剂,已广泛应用于工业有机溶剂中,是大气、土壤、地下水和食品中的常见污染物。由于肝脏是主要的TCE靶器官之一,TCE引起的肝损伤在职业工作者中经常被报道,TCE暴露被怀疑与肝癌的风险增加有关。在动物实验中,TCE处理可诱导小鼠肝细胞癌(HCC),但其机制尚不清楚。现分享一篇RNA转染(Entranster)与三氯乙烯和肝 …
阅读更多 »siRNA转染与PKC-β抑制剂和心脏微血管功能研究
PKC-β抑制剂Ruboxistaurin(RBX或βLY333531)可防止糖尿病肾和视网膜微血管并发症。然而,RBX对糖尿病心肌微血管功能的影响尚不清楚。先分享一篇运用siRNA转染(Entranster)的方法与PKC-β抑制剂对糖尿病大鼠心脏微血管功能研究的文献,以供参考。
阅读更多 »RNA转染(entranster)后沉默现象不明显怎么办?
可能原因: 1. RNA与转染试剂比例不佳。可进行预实验优化。 2. 细胞密度不佳。 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。 3. RNA效率不高。选择最优RNA,并采用已知高效的RNA做对照。 4. RNA酶污染。建议无RNA酶和内毒素的吸头、离心管和溶液等材料和实验器具。 5. 转染后培养时间不够。在mRNA水平可以到48 小时以后验证结果,在蛋白水 …
阅读更多 »