为了达到高的转染效率,在转染实验过程中,需要注意以下几点: 1.纯化siRNA siRNA的浓度和纯度对转染实验非常重要。为得到高纯度的siRNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致 …
阅读更多 »电转染时,指数衰减脉冲形式的电转条件是什么?
对于engreen的Entranster-E电转染试剂,当使用0.4cm比色杯时,大多数细胞类型的指数衰减脉冲条件在200-300V的电压范围和800-1000μF的电容范围内。对于0.2 cm比色杯时,其范围分别为80-160 V和800-1000μF。对于使用0.4 cm比色杯的电穿孔实验,测试电压范围 …
阅读更多 »siRNA转染效率不理想的原因是什么?
siRNA转染效率不理想,常见的原因有:1. RNA与转染试剂比例不佳 由于RNA序列差异、合成条件不同以及是否带有荧光等标记,决定了RNA和转染试剂在不同情况下会有不同的最佳条件,建议先进行预实验优化。2. 细胞密度不佳 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。成功转染siRNA的细胞会产生目标基因表达下调,但未成功转染的细胞却不受影响,这时转染效率和总 …
阅读更多 »siRNA答疑专题总结(上)
Q1:如果慢病毒载体中没有抗性标记,只有GFP,请问还能筛选稳转的细胞传代培养吗? A1:采用流式分选是流式细胞仪的一个功能,有流式细胞仪就可以了。一般实验室对流式都有专门的人员操作,不需要自己动手。由于没有抗性,需要注意分选过程的无菌操作。 Q2:RNA干扰如果用慢病毒做稳转的细胞株,什么样的目的RNA都可以用来干扰来做稳转的细胞株吗,目的RNA所编码蛋白 …
阅读更多 »PBMC细胞可以用电转染吗
PBMC细胞(外周血单个核细胞)可以通过电转染(electroporation)进行基因转染。然而,由于PBMC细胞包括T细胞、B细胞、单核细胞和NK细胞等多种类型,且这些细胞对电转染的敏感性和效率存在差异,电转染PBMC细胞需要特定的优化。 一些关键的注意事项包括: 电转染参数:PBMC电转染的参数(如电压、脉冲时间和次数)需要根据细胞类型进行优化。通常, …
阅读更多 »都说RNAi很容易降解,转染效率很低,是真的吗?
RNAi就是利用降解双链RNA的酶系统,人工引入一段和目标RNA互补的序列,这样,在细胞内形成双链RNA,诱发降解机制,使目标RNA降解,无法被进一步翻译。 在转染过程中,有人就在担心,dsRNA的稳定性是相对于单链RNA而言的!RNA怎么办? RNAi中,标准的非修饰的siRNA确实容易降解,这不仅在保存过程中,而且在转染过程中。对siRNA的降解,可以合 …
阅读更多 »siRNA表达载体的构建成功要点
对每个基因设计并检测两到四个siRNA序列 为了找到潜在靶位点,扫描靶基因中的AA序列。记录每个AA 3’端19个核苷酸作为潜在siRNA靶位点。潜在靶位点需通过GENBANK数据库的BLAST分析,去除那些与其它基因明显同源的靶位点。如果可能,siRNA应根据mRNA低二级结构的区域设计。 选择低GC含量的siRNA 纯化体外转录siRNA 在转染前要确认 …
阅读更多 »悬浮细胞难转染怎么办?
悬浮细胞是指细胞生长不依赖支持物表面,在培养液中呈悬浮状态生长,如淋巴细胞。在实验室经常会遇到悬浮细胞的转染,其和贴壁细胞转染还是有很大不同的。 目前大多数实验室用的是脂质体类的转染试剂,脂质体转染是基于电荷吸引原理,先形成脂质体-DNA复合物,散布在细胞周围,然后通过细胞的内吞作用,将目的基因导入细胞内,而脂质体复合物与贴壁细胞的接触机会 …
阅读更多 »使用血清时要注意哪些参数?
血清可以提供细胞生长所必需的生长因子和营养元素,某些细胞特别是转化后的细胞,对于血清的需要量是很低的,在0.5 %左右。有些细胞被“培养成“只生存在低血清浓度的培养基中。由于细胞生长所需的物质已经被完全定性,所以更多的细胞是被培养在添加有特定物质的基础培养基中。如果细胞能够生存在不添加血清的培养基中则是一种比较幸运的情况。 使用血清的时候有一些参数要注意: …
阅读更多 »RNA转染实验效率低的原因
RNA转染效率低,可能的原因: 1. 转染试剂不适合。建议选择RNA专用转染试剂,如Entranster。 2. 转染试剂和RNA的量不够,或者比例不对。优化实验条件,调整试剂和RNA用量,优化二者比例。 3.检测时间有问题。适当调整检测时间。 4. RNA质量问题。选择纯度高的RNA。 5. 细胞状态不佳。调整细胞状态,调整细胞融合度。
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