影响细胞转染效率低下的原因主要有: 1、细胞太少或细胞密度太大 细胞密度对转染效率有一定的影响。不同的转染试剂,要求转染时的最适细胞密度各不相同,即使同一种试剂,也会因不同的细胞类型或应用而异。转染时过高或者过低的细胞密度会导致转染效率降低,乃至表达水平偏低。因此如果选用新的细胞系或者新的转染试剂,最好能够进行优化实验并为以后的实验建立一个稳定方法,包括适当 …
阅读更多 »shRNA细胞系的筛选后发现,RNA水平没有变化,蛋白水平减少,是什么原因
在筛选 shRNA 细胞系后,如果你发现 RNA没有变化,但 蛋白水平减少,可能有多种原因。这里有一些可能的解释: 1. 转录后调控(Post-transcriptional regulation) miRNA或其他RNA调控:尽管shRNA能够靶向mRNA并降解其转录产物,细胞内可能存在 miRNA 或其他转录后调控机制(如RNA结合蛋白)影响 mRNA …
阅读更多 »细胞生长速度非常快,现在在密度20-30%时就开始转染,但是到了60小时后细胞密度已经非常高,几乎没有空隙。如果继续等待,是否会导致细胞状态不佳,从而影响到实验中蛋白的表达效果。
细胞密度确实会影响转染效率和蛋白表达。如果细胞密度过高,可能会导致以下问题: 营养和废物积累:高密度会导致培养基中的营养迅速消耗,废物积累增加,这会影响细胞的健康状态,进而影响蛋白表达。 转染效率降低:高密度时,转染试剂和DNA更难均匀分布,影响转染效率。 蛋白表达影响:过度拥挤的细胞状态可能导致蛋白表达效率下降,甚至可能出现表达异常。 建议: 调整转染密度 …
阅读更多 »如何上调或下调特定的miRNA?
miRNA通过与转录本的相互作用,关闭或抑制基因的表达。最近的研究表明它们影响了约三成的基因。miRNA在多个组织中差异表达,这就让表达图谱分析成为研究的重点。同时,miRNA的过表达和抑制也是近年来常用的研究方法。 然而,Peng Jin(埃默里大学) 我们使用RNA oligo和载体的方法。对于RNA oligo方法,我们采用类似siRNA双链的miRN …
阅读更多 »转染实验如何设置对照?
所有的转染实验均应包括对照,以检验各个试剂和制备的质粒DNA , 以及检测将要引入的基因或构建体的毒性。 瞬时表达的对照 阴性对照 在瞬时转染实验中,需要用载体DNA 和/或用于稀释待测质粒或基因的缓冲液转染一两个培养皿的细胞。通常采用鲑鱼精DNA 或用于构建重组体的空载体等其他惰性载体代替待测基因转染贴壁细胞。转染后,培养的细胞不应从培养皿上脱落,外观上也 …
阅读更多 »siRNA转染效率不理想的原因
siRNA转染效率不理想,常见的原因有: 1. RNA与转染试剂比例不佳 由于RNA序列差异、合成条件不同以及是否带有荧光等标记,决定了RNA和转染试剂在不同情况下会有不同的最佳条件,建议先进行预实验优化。 2. 细胞密度不佳 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。成功转染siRNA的细胞会产生目标基因表达下调,但未成功转染的细胞却不受影响,这时转染效率 …
阅读更多 »RNA转染(entranster)后沉默现象不明显怎么办?
可能原因: 1. RNA与转染试剂比例不佳。可进行预实验优化。 2. 细胞密度不佳。 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。 3. RNA效率不高。选择最优RNA,并采用已知高效的RNA做对照。 4. RNA酶污染。建议无RNA酶和内毒素的吸头、离心管和溶液等材料和实验器具。 5. 转染后培养时间不够。在mRNA水平可以到48 小时以后验证结果,在蛋白水 …
阅读更多 »siRNA转染效率不佳的原因
1. siRNA与转染试剂比例不佳 由于siRNA序列差异、合成条件不同以及是否带有荧光等标记,决定了siRNA和转染试剂在不同情况下会有不同的最佳条件,建议先进行预实验优化。 2. 细胞密度不佳 调整细胞密度到转染时汇合度为20-40%。成功转染siRNA的细胞会产生目标基因表达下调,但未成功转染的细胞却不受影响,这时转染效率和总的细胞数量就很重要,一般细 …
阅读更多 »怎样提高细胞转染效率?
1.选择合适的转染试剂 不同细胞系转染效率通常不同,但细胞系的选择通常是根据实验的需要,因此在转染实验前应根据实验要求和细胞特性选择适合的转染试剂。每种转染试剂都会提供一些已经成功转染的细胞株列表和文献,通过这些资料可选择最适合实验设计的转染试剂。当然,最适合的是高效、低毒、方便、廉价的转染试剂。如英格恩的 …
阅读更多 »细胞RNA转染的建议
为了做好RNA转染实验,提出几点关于细胞RNA转染实验的建议,供大家参考: 1.纯化RNA 在转染前要确认RNA的大小和纯度。为得到高纯度的RNA,推荐用玻璃纤维结合,洗脱或通过15-20%丙烯酰胺胶除去反应中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和盐离子。注意:化学合成的RNA通常需要跑胶电泳纯化(即PAGE胶纯化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶将导致 …
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