该方案是简单而且得到广泛应用的、利用PCR 模板制备双链RNA 的体外转录反应。该方法制备的dsRNA 可以用于在某些细胞或者组织中诱发RNA 干扰。 试剂 琼脂糖凝胶( 1 %)复性缓冲液( 10 X)ATP 、CTP 、GTP 、UTP ( 每种100mmol/L )二硫苏糖醇( DTT ) ( 1mol/L)DNA 分子质量标准dNTP 混合液,每种1 …
阅读更多 »基因克隆连接到T载体是不是多此一举?
T载体是TA克隆载体的简称,就是利用载体的T末端和PCR产物的A末段连接而将目的基因克隆到载体中的方法。我们都知道,做基因克隆目的基因连接到载体,使目的基因能够在受体细胞进行稳定遗传。部分朋友是把目的片段先克隆到T载体后再酶切连接目的载体的,有部分朋友就直接将PCR产物酶切连接到能够将目的基因带入受体细胞进行稳定遗传的载体中。那么进行TA克隆到底是不是多此一 …
阅读更多 »磷酸钙转染法实验原理及步骤
【实 验 原 理】 磷酸钙沉淀法是基于磷酸钙-DNA复合物的一种将DNA导入真核细胞的转染方法。磷酸钙有利于促进外源DNA与靶细胞表面的结合。磷酸钙-DNA复合物粘附到细胞膜并通过胞饮作用进入靶细胞,被转染的DNA可以在细胞内进行瞬时表达,也可整合到靶细胞的染色体上从而产生不同基因型和表型的稳定克隆。该方法可广泛用于转染许多不同类型的细胞。 【仪器、材料和试 …
阅读更多 »SDS 碱裂解法制备质粒DNA: 大量制备
近些年来,随着PCR 技术的出现,以及DNA 克隆和测序方法的发展,对大量质粒载体和重组子的需求也大大减少。因此,本方案曾一度广泛应用,但已经被更为快速和简便的柱纯化方法代替。在本方案中,通过碱裂解法的放大( Bimboim and Doly 1979 ) ,质粒DNA 可从清亮的细菌裂解物中通过含有溴化乙锭的CsCl 梯度离心来进行纯化。 无论是高拷贝数的 …
阅读更多 »Trizol法提取总RNA的原理及注意事项
原理:Trizol试剂是直接从细胞或组织中提取总RNA的试剂。在样品裂解或匀浆过程中,Trizol能保持RNA的完整性。加入氯仿后离心,样品分成水样层和有机层。RNA存在于水样层中。收集上面的水样层后,RNA可以通过异丙醇沉淀来还原。在除去水样层后,样品中的DNA和蛋白也能相继以沉淀的形式还原。乙醇沉淀能析出中间层的DNA,在有机层中加入异丙醇能析出有机层的 …
阅读更多 »做电泳实验必须要知道的基础知识
*样品制备 样品必须完全溶解于上样缓冲液,否则不能在凝胶中移动。样品太浓可能产生假相。 样品缓冲液包含盐类(维持样品)、甘油(增加重量从而使样品下沉至点样孔)、以及示踪染料(以便监测电泳进程)。 样品缓冲液可以分装成小部分冻存。 缓冲液加到凝胶上之后才能点样。 样品缓冲液中的示踪染料可以指示什么时候终止电泳。两种最常用的染料是漠酚蓝(BPB) 与二甲基苯青F …
阅读更多 »PCR 标记DNA
PCR 是通过热稳定酶,在模板、dNTPs 和一组与片段3′ 序列互补的引物存在下,对插入物进行次序扩增(Saiki et al. 1988) 。PCR 技术提供的另一优势是在对插入片段的扩增中掺入修正的核苷酸,因此可以生产出不含载体的标记的探针,这排除了在其他方法如缺口翻译所导致的对载体序列的非特异性标记。 目前已有掺入生物素化核苷酸的方法(L …
阅读更多 »做无菌实验前,你需要做好这些准备
工作区域尽可能地远离通风口和交通口。不应该开窗工作,也不要靠近门口。通风橱能够帮助无菌状态的保持,但它也不一定完全保证。 确保整洁的工作环境。拿走所有不用的仪器和设备,旧容器和箱子也不要放在近处,做完实验后,收拾干净实验台。 实验前用消毒剂或是清洁剂清洁工作区域。70 %的乙醇是最常用的(但也要根据不同实验室的情况决定,因为酒精不一定对那些特殊的污染物有效) …
阅读更多 »慢病毒感染后,未能实现相关敲降的原因是什么?
慢病毒感染后未能实现敲降的原因可能有多种。以下是一些可能的原因及其解释: 慢病毒包装质量问题: 病毒滴度较低,导致感染效率不高,可能无法有效转导目标细胞。 病毒颗粒中没有足够的有效载体,影响敲降效果。 靶向序列设计问题: shRNA或sgRNA设计不合理,没有有效靶向目标基因的序列。 目标序列与基因组其他部位的相似性导致脱靶效应,影响敲降效果。 感染条件不佳 …
阅读更多 »如何提高qPCR反应的灵敏度与特异性?
1. 首先确定模板RNA完整性好,无DNA污染。 2. RNA模板中不应含有扩增反应抑制剂。 3. 为了防止模板降解,在反应体系中加入RNase抑制剂RNasin。 4. 使用适量的模板RNA,模板量太多会降低特异性,太少会导致扩增不出条带或条带太弱。 5. 若模板中有二级结构,可通过提高逆转录反应温度来提高扩增效果。 6. 设计引物时,避免在引物3’端含有 …
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