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Rosetta模型是一套用于蛋白质结构预测、分子对接和设计的计算工具集，由2024年诺贝尔化学奖得主，华盛顿大学David Baker教授的实验室开发。Rosetta最初被设计用于蛋白质结构预测，但如今已发展成一套多功能的平台，被广泛应用于蛋白质折叠、蛋白质-蛋白质和蛋白质-小分子相互作用、以及新蛋白质设计等领域。 Rosetta模型的核心功能  1.蛋白质 …

计算蛋白质设计（Computational Protein Design）是一种利用计算机算法来设计具有特定功能和结构的蛋白质分子的方法。该领域的目标是通过计算预测蛋白质的结构与功能关系，以设计出符合特定需求的全新蛋白质或优化已有蛋白质，应用广泛于药物开发、酶工程、生物材料等领域。 计算蛋白质设计的核心步骤 确定设计目标：首先明确蛋白质设计的目标，例如设计具 …

《Nature》最新报道了癌症和生殖系中的 TOP1 转录相关诱变。突变情况由许多过程塑造，基因区域易受突变影响，但同时受到转录偶联修复的保护。在微生物中，转录诱变产生影响，但在高等真核生物中的影响仍有待确定。ID4 -a，指的是转录相关的诱变导致一种癌症相关的插入 – 缺失 突变特征，发生短片段（2 到 5 个碱基对）的缺失 。哺乳动物中的缺陷 …

mRNA疫苗的成功上市，让RNA疗法的研究再次成为科研界的焦点。 一直以来，小干扰RNA（siRNA）都是RNA研究的热点，它能够在多个水平实现基因的表达沉默，靶向治疗多种疾病。其实，除了基因沉默，还有可以激活目标基因表达的RNA技术，也就是RNA激活（RNAa），具有这种功能的RNA被称为小激活RNA（saRNA）。对于肿瘤免疫、代谢疾病来说，将saRNA …

全球每年有超过百万的人感染艾滋病病毒，超50万人死于艾滋病相关疾病。艾滋病自发现以来，即是人类的一大威胁。 1982年，该疾病被正式命名为“获得性免疫缺陷综合征”，英文简称AIDS，也就是我们所说的艾滋病。1983年，国际病毒分类委员会确认了导致艾滋病的元凶：「人类免疫缺陷病毒」，简称HIV。在这几十年间，HIV从非洲到了美洲、欧洲、亚洲……席卷了全球，造成 …

新冠爆发以来，mRNA疫苗的研发一直都受群众热议，尤其是Delta变异株的出现，让大家更是期盼国产mRNA疫苗早日上市。而从疫情爆发到现在接近两年，直到最近才有即将上市的消息传出，为什么国产mRNA疫苗的研发如此艰难呢？ 实际上，mRNA疫苗的研发主要包含两个核心技术：1.抗原的设计2.递送系统的设计。相对于抗原设计来说，递送系统更是难以突破的关键。 mRN …

1. A company born from passion and drive,  Engreen, with its mission to thrive. Dedicated to growth and innovation, Bringing solutions to life with dedication. From research to dev …

1.完全基因组 在去年5月发表的预印本中，人类共有基因组序列 GRCh38 添加了近 2 亿个新碱基对，并撰写了人类基因组的最后一章。 GRCh38 于 2013 年首次发布，一直是一个有价值的工具，但也存在漏洞。主要是因为测序技术产生的读数准确但较短。它们的长度不足以明确地绘制出高度重复的基因组序列，包括覆盖染色体末端的端粒和在细胞分裂过程中协调新复制的 …

过去的 15 年中，科学家们探索了心脏和大脑之间的发展联系。例如，在 2010 年，研究人员发现，小鼠胚胎中分裂和分化形成心脏的细胞与喉咙和下头的肌肉细胞来自同一个细胞池，两者的关键部件的来源是有同一处。 心头连接的开端—— 海鞘? 实际上，胚胎的头心连接早于脊椎动物的进化起源，甚至可能早于头本身。研究人员在研究海鞘时偶然发现了这种联系，这种海鞘是一种水滴状 …

蛋白质结构预测（Protein Structure Prediction）是一项利用计算方法预测蛋白质分子的三维结构的技术。由于蛋白质的功能很大程度上依赖于其三维结构，预测其结构对理解生物过程、药物设计等领域具有重要意义。然而，实验确定蛋白质结构（如X射线晶体学、核磁共振等方法）耗时费力，因此计算预测成为重要替代方法。 蛋白质结构预测的主要方法 同源建模（H …