对于藻类细胞电转效率特别低的问题,主要考虑以下。 质粒纯度和浓度: 如果质粒 DNA 的纯度不够,或者有蛋白质、RNA、内毒素等污染,可能会影响电转效率。建议确保质粒通过高质量的提取试剂盒提取,且 OD260/OD280 比率应在 1.8-2.0 之间。 质粒浓度过高或过低都可能影响转化率,建议对质粒浓度进行优化,一般而言,20-50 ng/μL 的浓度是比 …
阅读更多 »细胞电转后,72小时铺板加药筛选是否可行
一般情况下,在细胞电转后进行72小时的培养再加药筛选是可以的。具体取决于你的实验设计和细胞类型。以下几点你可以考虑: 细胞恢复时间:不同的细胞系在电转后需要不同的恢复时间,一般48-72小时是常见的恢复窗口。确保细胞已经充分恢复正常的代谢和生长活动。 药物筛选时间:72小时后加药筛选通常是为了确保细胞稳定表达你引入的基因或者达到特定的实验状态。如果是抗生素筛 …
阅读更多 »病毒感染的细胞与未感染的对照细胞相比,在相同浓度的嘌呤霉素(puromycin)处理下,病毒感染的细胞死亡更多的原因
这种现象可能由以下几个原因引起: 病毒感染对细胞的影响: 病毒感染(例如慢病毒载体的感染)会对细胞造成一定的压力,可能导致细胞的代谢、增殖状态和基因表达发生变化。即使是没有病毒基因组整合的病毒颗粒也可能激活细胞的应激反应、免疫反应,或者影响细胞的健康状态,从而导致细胞更容易受到药物(如嘌呤霉素)的影响并死亡。 病毒颗粒的毒性: 某些病毒载体本身可能具有一定的 …
阅读更多 »有Lenti序列的质粒可以直接转染目标细胞吗
带有Lenti序列的质粒通常不能直接转染目标细胞来实现功能,因为这些质粒设计的初衷是通过病毒介导的基因转导。慢病毒系统需要经过病毒包装步骤后才能有效感染并整合到目标细胞的基因组中。 原因: Lenti质粒本身无法感染细胞:Lenti载体质粒中虽然包含有病毒基因组的部分元件,但缺乏构成病毒颗粒所必需的结构蛋白。要将质粒中的基因传递给目标细胞,必须通过包装细胞来 …
阅读更多 »已经把miRNA转染到了SW480细胞中,用来抑制RUNX1的表达,从而抑制细胞行为。已经通过WB验证了转染三天后RUNX1受到了抑制。现在的问题是应该在转染三天后消化细胞再做划痕实验,还是先种板做划痕再进行转染。
我的建议: 通常来说,如果你想研究miRNA对划痕愈合(细胞迁移)的影响,建议先进行miRNA转染,等待足够的时间让miRNA发挥作用(你提到的是三天),然后再进行划痕实验。这可以确保在进行划痕实验时,RUNX1已经被下调,迁移实验所观察到的结果是由RUNX1抑制所导致的。 但如果你担心转染后细胞的粘附性不好或者转染效率不高,也可以先进行划痕实验,让细胞在板 …
阅读更多 »2024诺贝尔化学奖得主David Baker和他的Rosetta模型
Rosetta模型是一套用于蛋白质结构预测、分子对接和设计的计算工具集,由2024年诺贝尔化学奖得主,华盛顿大学David Baker教授的实验室开发。Rosetta最初被设计用于蛋白质结构预测,但如今已发展成一套多功能的平台,被广泛应用于蛋白质折叠、蛋白质-蛋白质和蛋白质-小分子相互作用、以及新蛋白质设计等领域。 Rosetta模型的核心功能 1.蛋白质 …
阅读更多 »2024诺贝尔化学奖之蛋白质结构预测
蛋白质结构预测(Protein Structure Prediction)是一项利用计算方法预测蛋白质分子的三维结构的技术。由于蛋白质的功能很大程度上依赖于其三维结构,预测其结构对理解生物过程、药物设计等领域具有重要意义。然而,实验确定蛋白质结构(如X射线晶体学、核磁共振等方法)耗时费力,因此计算预测成为重要替代方法。 蛋白质结构预测的主要方法 同源建模(H …
阅读更多 »2024年诺贝尔化学奖之计算蛋白质设计
计算蛋白质设计(Computational Protein Design)是一种利用计算机算法来设计具有特定功能和结构的蛋白质分子的方法。该领域的目标是通过计算预测蛋白质的结构与功能关系,以设计出符合特定需求的全新蛋白质或优化已有蛋白质,应用广泛于药物开发、酶工程、生物材料等领域。 计算蛋白质设计的核心步骤 确定设计目标:首先明确蛋白质设计的目标,例如设计具 …
阅读更多 »siRNA是从牵牛花过表达发现的吗
siRNA(small interfering RNA, 小干扰RNA)并不是从牵牛花的过表达现象中发现的,而是从研究植物基因沉默和RNA干扰现象中逐步发展起来的。siRNA的发现归功于对基因沉默和RNA干扰机制的研究,尤其是科学家在植物、真菌和线虫等生物中对这些现象的观察和研究。 siRNA发现的关键研究 植物基因沉默:在植物中,科学家观察到特定基因可以在 …
阅读更多 »慢病毒感染细胞后,细胞长满48小时是否可以先传代,再等到72小时再喷霉素筛选吗
通常在进行慢病毒感染后,建议遵循以下操作步骤: 感染后观察细胞状态:感染后一般在48-72小时内可以看到较为明显的表达,但是否开始筛选需要看细胞的状态和感染效率。如果细胞长满了,可以考虑先进行传代,以避免细胞过度拥挤影响生长和感染效果。 喷霉素筛选的时机:喷霉素通常在感染后48-72小时开始筛选,但实际开始筛选的时间取决于感染效率和细胞状态。如果细胞感染后状 …
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