1. 使用不同的启动子:为两个质粒选择不同类型的启动子,避免它们之间的竞争 这个建议是针对以下情况的: 启动子竞争效应:如果两个质粒使用相同或类似的启动子,尤其是强启动子(例如,CMV启动子),它们可能会争夺有限的转录因子和转录机制资源(如RNA聚合酶)。这种情况下,启动子竞争可能导致一个质粒的表达被抑制,从而影响另一个质粒的表达。 例如,如果两个质粒都使用 …
阅读更多 »哺乳动物细胞同时表达2个质粒,如果采用相同的启动子,会不会形成表达竞争
是的,如果哺乳动物细胞同时表达两个质粒,且这两个质粒使用相同的启动子,它们可能会发生表达竞争(expression competition)。这种情况通常会影响两个质粒上基因的表达水平,具体影响程度取决于多个因素。 原因 转录因子的竞争: 启动子区域的转录因子结合位点是有限的。如果两个质粒使用相同的启动子,它们可能会争夺同一批转录因子。这种竞争会导致转录因子 …
阅读更多 »shRNA细胞系的筛选后发现,RNA水平没有变化,蛋白水平减少,是什么原因
在筛选 shRNA 细胞系后,如果你发现 RNA没有变化,但 蛋白水平减少,可能有多种原因。这里有一些可能的解释: 1. 转录后调控(Post-transcriptional regulation) miRNA或其他RNA调控:尽管shRNA能够靶向mRNA并降解其转录产物,细胞内可能存在 miRNA 或其他转录后调控机制(如RNA结合蛋白)影响 mRNA …
阅读更多 »胞培养后转染,中间密,边上稀,可以转染吗
细胞培养后转染时,细胞的密度和分布对转染效果有很大影响。如果你观察到中间密度较高,而边缘较稀,可能会对转染效果产生一定的影响,具体情况取决于以下几个因素: 细胞密度: 理想的转染效果通常在细胞处于对数生长期时最好,这时候细胞分裂活跃,且增殖速度较快。细胞密度过低(例如在培养皿的边缘区域)时,细胞之间的接触较少,转染效率通常会较差。相反,密度过高时(例如培养皿 …
阅读更多 »双质粒共转染哺乳动物细胞,出现其中一个质粒表达量降低,而另一个质粒表达正常的情况,原因和解决办法
可能的原因: 质粒竞争效应: 在共转染过程中,两个质粒可能在转染效率、复制能力或表达资源(如转录因子和核糖体)上竞争。一个质粒可能因此受到抑制,导致其表达量下降。 解决方法: 提高低表达质粒的比例,例如2:1或更高。 尝试使用等摩尔浓度(而非等质量浓度)的质粒来转染。 质粒质量或纯度差异: 低表达质粒可能存在降解、污染或纯化不完全的问题,从而影响其转染效率或 …
阅读更多 »慢病毒滴度的计算
实验准备 目标细胞:选择适合慢病毒感染的细胞株(如 HEK293T 或靶细胞)。 病毒稀释:对病毒原液进行一系列梯度稀释(如 10−1,10−2,10−3,10−4)。 感染细胞:将稀释后的病毒感染到目标细胞中,确保设置对照组(未加病毒)。 培养:培养 48-72 小时(根据病毒系统和荧光/抗性蛋白表达时间调整)。 检测方法:检测报告基因表达水平(如荧光蛋白 …
阅读更多 »慢病毒感染中细胞密度需要考虑的因素
细胞类型: 不同细胞系对慢病毒的感染效率不同。例如,一些细胞对病毒更敏感,需要更低的病毒量和细胞密度。 敏感细胞系(如HEK293T):种植密度可稍低; 难感染细胞系(如原代细胞):需要更高密度。 病毒滴度: 如果病毒滴度高,细胞密度可以稍低。 如果病毒滴度较低,建议适当提高种植密度,并配合 增强试剂(如Envirus-LV) 提高感染效率。 LV感染目标: …
阅读更多 »慢病毒感染12孔板种植多少细胞合适
在慢病毒感染实验中,12孔板中种植的细胞密度需要根据以下因素优化: 一般种植密度建议: 悬浮细胞: 每孔种植 1×10⁵ 至 2×10⁵ 个细胞。 贴壁细胞: 每孔种植 5×10⁴ 至 1×10⁵ 个细胞。 对于贴壁细胞,建议种植后培养 24小时,让细胞达到约 30%-50% 的汇合度(confluency),然后进行病毒感染。这种密度能确保细胞有充足的分裂 …
阅读更多 »请问共转染的两种质粒需要选择不同载体吗
在基因转染实验中,共转染的两种质粒通常不一定需要选择不同的载体,但有一些情况下选择不同的载体可能会更有优势: 同源重组和重复序列问题:如果两个质粒使用相同的载体序列,可能会发生同源重组,导致质粒结构不稳定,尤其是在细菌扩增和分离时。这种情况下,选择不同载体可以降低同源重组的风险。 抗性筛选:如果需要通过抗生素筛选两种质粒,最好选择含有不同抗性基因的载体,以便 …
阅读更多 »细胞计数的方法
细胞计数是生物学研究和临床实验中常用的技术,用于确定样本中细胞的数量。根据不同的研究需要,细胞计数的方法有很多种。常见的细胞计数方法包括: 1. 显微镜计数法 显微镜计数法是最传统也是最常见的细胞计数方法,通常结合血球计数板(如 Neubauer 血球计数板)进行使用。 步骤: 将细胞悬液稀释到合适浓度。 使用血球计数板,置于显微镜下观察。 根据规则计算视野 …
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