在AAV病毒感染实验中,TU/mL(转导单位每毫升,Transduction Unit per milliliter)和vg/mL(病毒基因组拷贝数每毫升,Viral Genome copy per milliliter)是两种常见的病毒滴度单位。它们表示的是病毒浓度的不同方面:
- TU/mL:代表的是真正具有转导能力的AAV颗粒的数量,也就是能够在宿主细胞中有效感染并产生表达的病毒颗粒数。
- vg/mL:代表病毒基因组的数量,即AAV中携带的基因组拷贝数,通常是通过qPCR(定量PCR)检测出来的。
这两者之间的换算通常依赖于病毒颗粒的转导效率,但它们的关系并不是固定的,因为并不是所有的病毒颗粒都能成功感染细胞。
基本换算关系
- TU/mL 和 vg/mL 的关系通常由以下几个因素决定:
- AAV的载体质量和纯度(病毒颗粒中的无效颗粒可能没有转导能力)。
- 转导效率(即不同种类的AAV在不同细胞类型中的转导效率不同)。
一般来说,1 TU(转导单位)对应的病毒颗粒数会小于1 vg(病毒基因组拷贝),因为并不是每个病毒颗粒都有能力感染细胞。
- 估算公式: 由于转导效率的不同,这个关系通常依赖于实验条件和病毒的具体制备方法,但有一些大致的估算:
- 1 TU ≈ 10–100 vg。也就是说,转导单位的数量通常小于病毒基因组拷贝的数量。具体比例依赖于病毒的纯度和转导效率。
举例
如果你得到的AAV病毒滴度是:
- 1 × 10^12 vg/mL(病毒基因组拷贝数)
- 假设转导效率大约为10%(即大约10%的病毒颗粒能有效感染细胞),那么大致的转导单位(TU)滴度可能是:
1×1012 vg/mL×10%≈1×1011 TU/mL这意味着每毫升溶液中大约有 1×1011 个有效转导单位。
需要注意的事项:
- 不同病毒株之间的转导效率差异:不同的AAV血清型、病毒的纯化方法等因素都会影响TU与vg之间的比例。
- 实验条件:在不同的细胞类型和实验条件下,转导效率和基因组拷贝数之间的关系可能会有所不同。
总结
TU/mL 和 vg/mL 之间的换算关系取决于病毒的转导效率,通常是 1 TU ≈ 10-100 vg,但实际的转换比例会因实验条件的不同而有所变化。如果需要更精确的换算,建议进行实验验证或参考文献中相似系统的转换经验。