既然目标蛋白的半衰期是30小时,说明它在细胞中相对稳定,也就是说,蛋白不会很快降解。
在使用siRNA干扰该蛋白的表达时,有几个关键时间点需要考虑:
一般siRNA作用流程:
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转染后6–12小时:siRNA开始被细胞利用,mRNA水平开始下降。
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24–48小时:mRNA水平通常显著降低(具体情况因靶基因和细胞类型而异)。
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48–72小时:蛋白水平逐步下降,尤其是对于半衰期较长的蛋白,需要更多时间来看到明显变化。
针对你这个情况:蛋白半衰期为30小时
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这意味着即使mRNA被抑制了,蛋白仍然要1–2天才会逐步降解。
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所以,如果你要观察蛋白表达水平的下降(Western blot等),建议在转染后48小时到72小时收样比较合适。
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48小时:通常能看到一定蛋白下降;
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72小时:蛋白下降最明显,但也要注意siRNA的效应是否仍然持续。
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如果你只看mRNA表达(qPCR),可以在24小时左右收样。
总结建议:
检测内容 | 建议收样时间 |
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mRNA | 24小时左右 |
蛋白 | 48–72小时 |