病毒感染的细胞与未感染的对照细胞相比，在相同浓度的嘌呤霉素（puromycin）处理下，病毒感染的细胞死亡更多的原因

这种现象可能由以下几个原因引起：

1. 病毒感染对细胞的影响：
   • 病毒感染（例如慢病毒载体的感染）会对细胞造成一定的压力，可能导致细胞的代谢、增殖状态和基因表达发生变化。即使是没有病毒基因组整合的病毒颗粒也可能激活细胞的应激反应、免疫反应，或者影响细胞的健康状态，从而导致细胞更容易受到药物（如嘌呤霉素）的影响并死亡。
2. 病毒颗粒的毒性：
   • 某些病毒载体本身可能具有一定的细胞毒性，尤其是在高滴度的情况下，这会导致细胞对抗生素或其他化学应激的耐受性下降。病毒载体可能干扰细胞的正常生理功能，使细胞对嘌呤霉素更加敏感。
3. 感染过程的选择性压力：
   • 在病毒感染过程中，尤其是使用嘌呤霉素筛选时，如果病毒携带的是puromycin抗性基因，部分未成功转导的细胞或转导效率较低的细胞可能无法有效表达puromycin抗性蛋白，导致这些细胞在嘌呤霉素处理下更容易死亡。
4. 多重转染或多次感染的影响：
   • 如果细胞经历了多重感染或者是高效病毒感染，可能会在基因组中整合过多的外源基因，产生不稳定的基因组，进而影响细胞的增殖和存活。
5. 病毒载体本身的设计：
   • 某些病毒载体中的启动子或者目的基因表达可能会对细胞产生毒性。例如，如果病毒载体驱动某些有害基因的表达，或目的基因过表达，这会导致细胞对嘌呤霉素更为敏感。

建议：

• 您可以检查病毒载体是否携带任何可能影响细胞存活的基因。
• 确认病毒的感染效率及其对细胞的影响，是否因为过度感染导致细胞压力增加。
• 尝试调整病毒感染的滴度，观察细胞在嘌呤霉素选择时的耐受性变化。
• 同时也可以使用更低浓度的嘌呤霉素，逐步优化药物筛选条件。