小量制备可以从细菌培养物中抽提和分析,离心机12 或16 管足够一次制备。
一、材料
- 5 ml 过夜培养细菌培养物。使用LB培养基加入合适的抗生素培养单克隆菌体,37’C 振荡培养
- 灭菌的微桩离心管
- 冰
- 溶液I (裂解缓冲液, 25 mmol/L Tr的HCI pH8.0, 50 mmol/L葡萄糖, 10 mmol/LEDTA) ,冰上预冷
- 溶液II (变性缓冲液, 0.2 N NaOH, 1.0 % SOS) ,现配现用,室温保存
- 溶液III (复性缓冲液, 5 mol/L KAc 。制备方法:配制120 ml KAc 再加入23 ml 冰醋酸和57 ml 水,总体积为200 ml ) 冰上预冷
- TE
- 70% 和100% 乙醇
- RNase A (无DNase) ,配成2 mg/ml 溶液,分装并保存于- 20’C 。可以按程序制备RNase A (无DNase) ,也可以直接购买
二、步骤
- 加入1.5 ml 培养物于离心管中。
- 10000 g 离心2 min, 低温离心更佳,弃尽上清。
- 将菌体重悬于100 μl 预冷的溶液I, 振荡2 min 。
- 将离心管于室温下放置5min, 细菌将会裂解而释放DNA。
- 加入200 μI 溶液II上下颠倒离心管5s以混合,振荡会损伤DNA 。
- 冰浴5 min 。
- 加入溶液III并颠倒离心管20 s以混匀。
- 冰浴5 min, 质粒DNA 将被选择性的复性。
- 12000g 离心5 min 。
- 用移液头将上清转移至另一个离心管。
- 加入5μI 2 mg/ml RNase A (无DNase), 37℃温育5min 。
- 加入450 μI 酚-氯仿抽提RNase A 和蛋白质。
- 用氯仿抽提。
- 加入1 ml 预冷的乙醇并于-80’C 沉淀20 min 。
- 吸去或倒掉上清。
- 用70% 乙醇洗涤沉淀,离心1 min, 吸去上清。
- 于真空中干燥5 min,也可将离心管倒置于纸巾上吸干并干燥30 min 。
- 用25 μI TE 重悬沉淀,取2~4 μl 电泳检测并将余下DNA 于-20’C 保存。