英格恩生物技术博客 生物实验干货分享

测序正确是一个重要的验证步骤，但它不能完全说明shRNA构建没有问题。下面我会具体说明为什么。 测序正确说明了什么？ shRNA序列（包括发夹结构、目标序列）与设计一致： 如果你对构建后的质粒进行了Sanger测序，序列结果和你设计的shRNA完全一致，这说明你的克隆步骤（连接、转化等）是成功的。这意味着你至少在DNA水平上构建了正确的序列结构。 但这并不代 …

这是一个很重要也很实际的问题——瞬时转染效率是RNA干扰或质粒表达实验中一个关键变量，但很多人低估了它对结果的影响。 问题核心： 你说得非常对： “荧光镜下看感觉无法量化和保证每个组别的转染效率完全一致。” 用荧光镜看确实是定性评估，不够准确，且不同组别（尤其不同处理条件）可能转染效率不同，导致后续敲低效率、蛋白表达等结果不具可比性。 几种常见的转染效率评估 …

你遇到的这个问题在慢病毒（lentivirus）介导的RNA干扰实验中其实挺常见，下面我们逐步分析下可能的原因： 实验现象简述： siRNA转染敲得很有效（蛋白水平明显降低）； **将siRNA序列构建进慢病毒（shRNA形式）**后感染细胞； 荧光表达很强（说明病毒成功进入细胞，且有表达）； 但目标蛋白并未敲低，几乎没有 knockdown 效果。 可能原 …

可以，但得分情况来看： 如果质粒是线性化了（即被酶切成线状DNA）： 可以电转，但是效率明显低于超级螺旋质粒（超螺旋 plasmid，通常是未切割、天然状态下的质粒结构）。 线性质粒在细胞内容易被核酸酶降解，稳定性和转化成功率比超螺旋质粒低很多。 有些时候，比如做基因组编辑（CRISPR knock-in）、整合型表达载体（需要基因组插入时），反而故意使用线 …